MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 1

Total Repeats: 98606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011000	GCG	2	6	522	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558404
2	NC_011000	CG	3	6	539	544	0 %	0 %	50 %	50 %	206558404
3	NC_011000	GTTC	2	8	594	601	0 %	50 %	25 %	25 %	206558404
4	NC_011000	CGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558404
5	NC_011000	GCT	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
6	NC_011000	CTG	3	9	668	676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
7	NC_011000	GCC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558404
8	NC_011000	TCG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
9	NC_011000	TCGTGC	2	12	765	776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
10	NC_011000	GCGATC	2	12	830	841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206558404
11	NC_011000	GC	3	6	883	888	0 %	0 %	50 %	50 %	206558404
12	NC_011000	GCTG	2	8	972	979	0 %	25 %	50 %	25 %	206558404
13	NC_011000	AAG	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558404
14	NC_011000	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558404
15	NC_011000	GTTC	2	8	1041	1048	0 %	50 %	25 %	25 %	206558404
16	NC_011000	TCG	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
17	NC_011000	TCG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
18	NC_011000	CG	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	206558404
19	NC_011000	CGA	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558404
20	NC_011000	CGA	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558404
21	NC_011000	TTCG	2	8	1123	1130	0 %	50 %	25 %	25 %	206558404
22	NC_011000	GCT	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
23	NC_011000	GCT	3	9	1201	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
24	NC_011000	CAT	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558404
25	NC_011000	GAA	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558404
26	NC_011000	CGGC	2	8	1272	1279	0 %	0 %	50 %	50 %	206558404
27	NC_011000	GCT	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
28	NC_011000	GGT	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558404
29	NC_011000	CGT	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
30	NC_011000	CGG	2	6	1345	1350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558404
31	NC_011000	GCT	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
32	NC_011000	TCG	2	6	1383	1388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
33	NC_011000	CGT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
34	NC_011000	TCG	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
35	NC_011000	TACC	2	8	1507	1514	25 %	25 %	0 %	50 %	206558404
36	NC_011000	GC	3	6	1543	1548	0 %	0 %	50 %	50 %	206558404
37	NC_011000	TCG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558404
38	NC_011000	CGG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558404
39	NC_011000	GTC	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558405
40	NC_011000	GGC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558405
41	NC_011000	GGC	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558405
42	NC_011000	TCCCGA	2	12	2082	2093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206558405
43	NC_011000	GC	3	6	2096	2101	0 %	0 %	50 %	50 %	206558405
44	NC_011000	CTG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558405
45	NC_011000	CGT	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558405
46	NC_011000	CG	3	6	2239	2244	0 %	0 %	50 %	50 %	206558405
47	NC_011000	GAG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558405
48	NC_011000	CGT	2	6	2304	2309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558405
49	NC_011000	CGC	2	6	2387	2392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558405
50	NC_011000	GTCG	2	8	2394	2401	0 %	25 %	50 %	25 %	206558405
51	NC_011000	CGC	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558405
52	NC_011000	CG	3	6	2439	2444	0 %	0 %	50 %	50 %	206558405
53	NC_011000	CTG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558405
54	NC_011000	ACCG	2	8	2455	2462	25 %	0 %	25 %	50 %	206558405
55	NC_011000	GGA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558405
56	NC_011000	CGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558405
57	NC_011000	CG	4	8	2639	2646	0 %	0 %	50 %	50 %	206558405
58	NC_011000	CGA	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558405
59	NC_011000	GC	3	6	2677	2682	0 %	0 %	50 %	50 %	206558405
60	NC_011000	ACG	2	6	2687	2692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558405
61	NC_011000	GCA	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558405
62	NC_011000	GTGA	2	8	2768	2775	25 %	25 %	50 %	0 %	206558405
63	NC_011000	A	6	6	2775	2780	100 %	0 %	0 %	0 %	206558405
64	NC_011000	TGC	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558406
65	NC_011000	TGC	4	12	3422	3433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558406
66	NC_011000	CCA	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558406
67	NC_011000	TCG	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558406
68	NC_011000	GAC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558406
69	NC_011000	CG	3	6	3565	3570	0 %	0 %	50 %	50 %	206558406
70	NC_011000	GAA	2	6	3609	3614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558406
71	NC_011000	CG	3	6	3688	3693	0 %	0 %	50 %	50 %	206558406
72	NC_011000	CTG	2	6	3694	3699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558406
73	NC_011000	CGC	3	9	3734	3742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558406
74	NC_011000	GAA	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558406
75	NC_011000	GCG	2	6	3811	3816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558406
76	NC_011000	GAA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558406
77	NC_011000	AGA	3	9	3890	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558406
78	NC_011000	GAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558407
79	NC_011000	ATGTCG	2	12	4044	4055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206558407
80	NC_011000	TCG	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558407
81	NC_011000	CGG	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558407
82	NC_011000	ACG	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
83	NC_011000	CGA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
84	NC_011000	CGC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558407
85	NC_011000	GC	3	6	4224	4229	0 %	0 %	50 %	50 %	206558407
86	NC_011000	CG	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	206558407
87	NC_011000	GC	4	8	4251	4258	0 %	0 %	50 %	50 %	206558407
88	NC_011000	GCA	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
89	NC_011000	GCCG	2	8	4313	4320	0 %	0 %	50 %	50 %	206558407
90	NC_011000	CGC	2	6	4326	4331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558407
91	NC_011000	CGA	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
92	NC_011000	TGC	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558407
93	NC_011000	GCC	2	6	4431	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558407
94	NC_011000	GCA	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
95	NC_011000	CGC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558407
96	NC_011000	CG	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	206558407
97	NC_011000	GCA	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558407
98	NC_011000	GGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558407
99	NC_011000	GCG	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
100	NC_011000	CGAC	2	8	4971	4978	25 %	0 %	25 %	50 %	206558408
101	NC_011000	GCT	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558408
102	NC_011000	GAC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558408
103	NC_011000	CGC	2	6	5128	5133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558408
104	NC_011000	GCG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
105	NC_011000	GGC	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
106	NC_011000	GGC	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
107	NC_011000	CGC	3	9	5295	5303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558408
108	NC_011000	CG	3	6	5368	5373	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
109	NC_011000	GCG	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
110	NC_011000	CTG	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558408
111	NC_011000	CGC	2	6	5436	5441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558408
112	NC_011000	CGA	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558408
113	NC_011000	CGG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
114	NC_011000	CG	3	6	5475	5480	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
115	NC_011000	GC	3	6	5521	5526	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
116	NC_011000	CGAC	2	8	5568	5575	25 %	0 %	25 %	50 %	206558408
117	NC_011000	GGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
118	NC_011000	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558408
119	NC_011000	GTC	2	6	5659	5664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558408
120	NC_011000	CGG	2	6	5665	5670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
121	NC_011000	CGC	2	6	5676	5681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558408
122	NC_011000	AGA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558408
123	NC_011000	GC	3	6	5737	5742	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
124	NC_011000	CGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558408
125	NC_011000	TCG	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558408
126	NC_011000	GC	4	8	5837	5844	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
127	NC_011000	CGG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558408
128	NC_011000	GC	3	6	5892	5897	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
129	NC_011000	GCC	2	6	5908	5913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558408
130	NC_011000	CG	3	6	5934	5939	0 %	0 %	50 %	50 %	206558408
131	NC_011000	GCGA	2	8	6264	6271	25 %	0 %	50 %	25 %	206558409
132	NC_011000	GGAA	2	8	6279	6286	50 %	0 %	50 %	0 %	206558409
133	NC_011000	CGAG	2	8	6312	6319	25 %	0 %	50 %	25 %	206558409
134	NC_011000	GGC	2	6	6353	6358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558409
135	NC_011000	GC	4	8	6387	6394	0 %	0 %	50 %	50 %	206558409
136	NC_011000	GC	3	6	6411	6416	0 %	0 %	50 %	50 %	206558409
137	NC_011000	GT	3	6	6447	6452	0 %	50 %	50 %	0 %	206558409
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139	NC_011000	TGCGG	2	10	6563	6572	0 %	20 %	60 %	20 %	206558409
140	NC_011000	CGA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558409
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142	NC_011000	AGA	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558409
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146	NC_011000	CGGC	2	8	6862	6869	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
147	NC_011000	CG	3	6	6894	6899	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
148	NC_011000	CAC	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558410
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157	NC_011000	CG	3	6	7155	7160	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
158	NC_011000	CG	3	6	7176	7181	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
159	NC_011000	CG	3	6	7191	7196	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
160	NC_011000	GCA	3	9	7246	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558410
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164	NC_011000	CGC	2	6	7376	7381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558410
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167	NC_011000	CG	3	6	7428	7433	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
168	NC_011000	CAG	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558410
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170	NC_011000	CGG	2	6	7471	7476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558410
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172	NC_011000	CG	4	8	7519	7526	0 %	0 %	50 %	50 %	206558410
173	NC_011000	GCC	2	6	7530	7535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558410
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247	NC_011000	CGA	2	6	10770	10775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558414
248	NC_011000	CG	3	6	10786	10791	0 %	0 %	50 %	50 %	206558414
249	NC_011000	GCA	2	6	10797	10802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558414
250	NC_011000	GC	3	6	10813	10818	0 %	0 %	50 %	50 %	206558414
251	NC_011000	GCT	2	6	10824	10829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558414
252	NC_011000	GAC	2	6	10936	10941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558414
253	NC_011000	GCT	2	6	11119	11124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
254	NC_011000	TGC	2	6	11130	11135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
255	NC_011000	CG	3	6	11147	11152	0 %	0 %	50 %	50 %	206558415
256	NC_011000	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558415
257	NC_011000	CGGC	2	8	11200	11207	0 %	0 %	50 %	50 %	206558415
258	NC_011000	GGC	2	6	11224	11229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558415
259	NC_011000	TGC	2	6	11256	11261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
260	NC_011000	GCTCGG	2	12	11272	11283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206558415
261	NC_011000	ATC	2	6	11330	11335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558415
262	NC_011000	CAG	3	9	11345	11353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558415
263	NC_011000	TGC	2	6	11361	11366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
264	NC_011000	GGT	2	6	11389	11394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558415
265	NC_011000	CTG	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
266	NC_011000	TCG	2	6	11421	11426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558415
267	NC_011000	TGA	2	6	11457	11462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558415
268	NC_011000	GAC	2	6	11515	11520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558415
269	NC_011000	GC	3	6	11535	11540	0 %	0 %	50 %	50 %	206558415
270	NC_011000	CAG	2	6	11677	11682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558416
271	NC_011000	CGCGAC	2	12	11692	11703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	206558416
272	NC_011000	TCC	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206558416
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276	NC_011000	CG	3	6	11889	11894	0 %	0 %	50 %	50 %	206558416
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284	NC_011000	CG	3	6	12051	12056	0 %	0 %	50 %	50 %	206558416
285	NC_011000	CGT	2	6	12060	12065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558416
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294	NC_011000	CGA	2	6	12495	12500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558417
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296	NC_011000	CGC	2	6	12647	12652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558417
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302	NC_011000	CGG	2	6	12753	12758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558417
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334	NC_011000	GCGG	2	8	13911	13918	0 %	0 %	75 %	25 %	206558418
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341	NC_011000	GC	3	6	14174	14179	0 %	0 %	50 %	50 %	206558418
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359	NC_011000	GAC	2	6	14940	14945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558418
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372	NC_011000	GCG	2	6	15686	15691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558419
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376	NC_011000	CGA	2	6	15812	15817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558419
377	NC_011000	CG	3	6	15833	15838	0 %	0 %	50 %	50 %	206558419
378	NC_011000	CAT	2	6	15845	15850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558419
379	NC_011000	CG	3	6	15921	15926	0 %	0 %	50 %	50 %	206558419
380	NC_011000	ATTTC	2	10	15938	15947	20 %	60 %	0 %	20 %	206558419
381	NC_011000	AGCG	2	8	15954	15961	25 %	0 %	50 %	25 %	206558419
382	NC_011000	CGA	2	6	15977	15982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558419
383	NC_011000	CG	3	6	15984	15989	0 %	0 %	50 %	50 %	206558419
384	NC_011000	GC	4	8	16064	16071	0 %	0 %	50 %	50 %	206558419
385	NC_011000	CGA	2	6	16081	16086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558419
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387	NC_011000	CGA	2	6	16118	16123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558419
388	NC_011000	AAG	2	6	16176	16181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558419
389	NC_011000	TGG	2	6	16207	16212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558419
390	NC_011000	ACA	2	6	16216	16221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558419
391	NC_011000	GAA	2	6	16307	16312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558419
392	NC_011000	GGA	2	6	16390	16395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558420
393	NC_011000	GCG	2	6	16407	16412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558420
394	NC_011000	GTC	2	6	16514	16519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558420
395	NC_011000	GCT	2	6	16522	16527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558420
396	NC_011000	ACG	3	9	16550	16558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558420
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400	NC_011000	TCT	2	6	16689	16694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558420
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405	NC_011000	CGA	2	6	16765	16770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558420
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497	NC_011000	CG	3	6	19831	19836	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
498	NC_011000	GCC	2	6	19837	19842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558423
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